Aunque lejos de la popularidad de franquicias como Street Fighter o Mortal Kombat, Skullgirls logró construir una base de jugadores muy sólida a lo largo de los años y ahora es considerado un título de culto. Además, llegó a nuevos horizontes con un spin-off para móviles. No obstante, una serie de cambios causó controversia y el enfado de un sector de la comunidad.