Por el año de 1813 volvió a dividirse la Comandancia General de las Provincias Internas, quedando nombrado D. Joaquín Arredondo jefe de las de Oriente, siendo Calleja el Virrey. Arredondo llego de Veracruz con una bien organizada, expedición militar (1811), que tenía por objetivo cortar la retirada de D. Miguel Hidalgo y sus compañeros, quienes avanzaban hacia el Norte. Desembarcó en la barra de Tampico y, después de una campaña general por toda la Colonia de Santander, en donde acabó con los insurgentes, usando procedimientos despóticos y crueles, puso su cuartel general en la Villa de Aguayo, hoy Victoria, Tamps.
El nombramiento de comandante de estas Provincias lo recibió Arredondo en Agualeguas, cuando venía a expedicionar por Texas, en donde Gutiérrez de Lara, iniciaba formalmente su movimiento de insurrección. Después de esta campaña tan desagraciada para las armas insurgentes, Arredondo vino a Monterrey (julio de 1814) estableciendo aquí su cuartel general. En 1817 Arrendondo hizo la campaña en contra de D. Francisco Xavier Mina, tomando el fuerte que éste construyó en Soto la Marina, en donde tocó estar al célebre Dr. Fray Servando Teresa de Mier quien, preso y cargado de grillos, fue remitido a México.